协议与 SOP

1. 填写「协议标题」（必填）：建议使用标准化命名格式，包含编号和描述性名称。例如：「SOP-BIO-001：细胞复苏标准操作规程」。清晰的命名有助于团队成员快速识别和搜索。
2. 选择「类别」（必填）：对协议进行分类，方便筛选和浏览。
   • 样品处理：涉及样品采集、储存、制备的操作
   • 仪器操作：仪器的标准使用和维护规程
   • 数据分析：数据处理、计算和报告规程
   • 安全规程：实验室安全操作和应急处置
   • 培训：新成员培训材料和考核规程
   • 自定义类别：在「设置 → 协议类别」中添加机构专属类别
3. 填写「适用范围」（选填）：描述该协议适用的实验类型、样品类型或仪器。例如：「适用于所有需要使用流式细胞仪（BD FACSCanto II）分析细胞表面标记物的实验」。
4. 选择「作者」：默认为当前登录用户，可以更改为其他团队成员（例如，由助理录入但实际由 PI 起草的协议）。
5. 选择「审核人」（建议填写）：协议发布前需要审核并电子签名的团队成员。通常为资深研究人员或 PI。可以选择多位审核人（所有审核人都需签名方可发布）。
6. 设置「有效期」（选填）：协议的有效期限，到期后系统提醒重新审核。对于受监管环境，通常为 1–2 年。
7. 点击「创建草稿」，进入协议编辑器界面。

一份完整的 SOP 通常包含以下章节（可根据需要增删）：

在协议编辑器中，使用 / 命令（斜杠命令）快速插入特殊格式：

在科研和合规场景中，协议版本控制解决以下关键问题：

• 可溯源性：2 年前的实验使用的是哪个版本的 PCR 方案？版本历史提供明确答案。
• 合规要求：GLP/GMP 法规要求记录方法变更，证明任何修改都经过审核批准。
• 防止误用：发布机制确保团队成员只使用经过批准的版本，而非个人修改版。
• 变更影响分析：通过版本 diff 功能，可以精确了解每次修订改变了哪些内容。

1. 打开已发布协议的详情页，点击右上角「创建新版本」按钮。
2. 在弹出对话框中选择版本类型：「次要修订」或「主版本更新」。选择后系统自动建议下一版本号（如 v1.2 或 v2.0）。
3. 填写「变更说明」（必填）：简要描述本次版本修改的内容和原因。例如：「根据 2024-03-15 的实验室审核意见，将步骤 4 的离心时间从 5 分钟调整为 8 分钟，以提高细胞回收率。」
4. 点击「创建草稿」，系统创建一个与当前发布版本内容相同的新草稿，在编辑器中打开。
5. 在编辑器中进行必要的修改，修改内容实时自动保存。
6. 修改完成后，若为次要修订可直接点击「发布」；若为主版本更新，需先点击「提交审核」完成审核流程后再发布。
7. 新版本发布后，旧版本自动变为「历史版本」状态，团队成员使用协议时默认看到最新发布版本。

1. 在协议详情页，点击「版本历史」标签，查看所有版本列表（含版本号、创建时间、创建人、变更说明）。
2. 勾选任意两个版本（通过左侧复选框），点击「比较版本」按钮。
3. 系统显示并排或内联 diff 视图：新增内容以绿色高亮，删除内容以红色删除线显示，未变化内容以灰色显示。
4. 点击「导出 Diff 报告」可将差异对比导出为 PDF，用于变更控制文档。

1. 协议编写完成后，在协议详情页点击「提交审核」按钮。协议状态变为 待审核，系统通知所有指定审核人。
2. 审核人登录后，在「通知」中点击链接或在协议列表中找到「待审核」状态的协议，打开详情页。
3. 审核人仔细阅读协议内容，可以：
   • 在文档中选中文字后点击「添加评论」，提出具体修改意见（行内评论）
   • 在协议底部「评论区」发表整体意见
   • 如需修改：点击「退回作者」，填写退回原因，协议状态回到草稿，作者收到通知
4. 若内容符合要求，审核人点击「批准并签名」：
   • 系统弹出电子签名对话框
   • 审核人输入账号密码（不接受免密认证）进行身份验证
   • 系统记录签名：姓名、邮箱、时间戳（UTC 精确到毫秒）、IP 地址、签名含义「已审核并批准此协议版本」
5. 若设置了多位审核人，所有审核人都完成签名后，SUPER_ADMIN 或 PI 可以点击「发布」，协议状态变为 已发布，对全团队可见。

协议发布后，以下变化立即生效：

• 协议出现在「新建实验」表单的「关联协议」下拉选择列表中
• 可在实验编辑器中使用 /protocol 命令嵌入协议步骤
• 出现在「协议列表」的「已发布」筛选结果中，团队所有成员可见
• 可以被选为「培训协议」用于成员培训考核
• 若已配置，可发布到「模板市场」供其他团队使用

1. 在实验记录编辑器中，找到已嵌入的协议引用块。若尚未嵌入，输入 /protocol 命令并搜索选择目标协议。
2. 点击协议引用块右侧的「开始执行」按钮，进入协议执行模式。
3. 系统为协议中的每个 /step 步骤显示独立的确认块，包含：
   • 步骤序号和内容描述
   • 空白的「实际操作记录」文本框（执行者填写实际参数、观测结果）
   • 「✓ 确认完成」按钮和「记录偏差」按钮
4. 按步骤顺序执行操作。每完成一步，在「实际操作记录」中填写观测到的结果（非必填，但强烈建议填写），然后点击「确认完成」。
5. 所有步骤完成后，执行进度显示为 100%，协议执行块顶部出现绿色「执行完成」标记，记录完成时间戳。

• 协议执行块顶部显示进度条，如「已完成 4/8 步骤」
• 已完成步骤显示绿色对勾和完成时间戳；有偏差的步骤显示橙色警告图标
• 中途关闭实验页面后，下次打开时执行进度自动恢复
• 同一实验中同一协议可以多次执行（如多轮重复实验），每次执行记录独立存档

以下情况应记录偏差（即使你认为影响不大）：

• 使用了不同品牌或批次的试剂
• 操作参数（温度、时间、浓度等）与协议规定不符
• 省略了协议中的某个步骤（如因仪器故障）
• 使用了替代设备（如指定仪器正在维修）
• 操作顺序与协议不同
• 样品数量或规格与协议规定不符

1. 在协议执行模式中，在发现偏差的步骤旁点击「记录偏差」按钮（橙色），打开偏差记录表单。
2. 选择「偏差类型」：
   • 材料替换：使用了不同的试剂/耗材
   • 参数调整：温度、时间、浓度等参数与规定不符
   • 步骤省略：跳过了某个协议步骤
   • 步骤变更：改变了操作顺序或操作方式
   • 仪器替代：使用了不同的仪器设备
   • 其他：不属于以上类型的偏差
3. 填写「实际操作描述」（必填）：详细描述实际执行的操作内容，以及与协议规定的具体差异。例如：「协议要求使用 Taq DNA 聚合酶（NEB），实验室库存已用尽，改用 FastTaq（Thermo Fisher）。」
4. 填写「偏差原因」（必填）：说明为什么产生了偏差。例如：「库存耗尽，补货需要 3 天，实验时间节点不允许等待。」
5. 评估「对结果的潜在影响」：
   • 低 — 预计对实验结果无实质影响，两种材料性能相当
   • 中 — 可能对结果有一定影响，需要与协议规定的方法做对照实验确认
   • 高 — 可能显著影响结果的可靠性或实验的合规性，需要质量审查
6. 点击「保存偏差记录」。偏差记录与该步骤绑定显示，并计入实验记录的偏差汇总。
7. 若偏差影响评级为「高」，且团队已配置相关自动化规则，系统自动弹出「创建 CAPA」提示（详见合规 → CAPA 管理）。

1. 在协议详情页，点击「设置」标签，找到「培训要求」区域。
2. 勾选「作为培训材料」，开启培训功能。
3. 设置「培训有效期」：培训记录在多少个月后过期（到期需重新培训）。常见设置：12 个月（年度复训）或 24 个月（两年一次）。
4. 选择「培训方式」：
   • 自学阅读：成员自行阅读协议并确认
   • 现场培训：由培训师现场指导，由管理员记录完成情况
   • 带教实操：在带教老师监督下完成首次实际操作
5. 点击「保存设置」。

1. 管理员进入「设置 → 团队成员 → 培训记录」。
2. 找到目标成员，点击「添加培训记录」。
3. 选择培训的协议（从已发布培训协议列表中选择）。
4. 填写「培训完成日期」和「培训方式」，可上传培训证明文件（如签到表、考核结果）。
5. 点击「保存」，系统记录本次培训并计算下次到期时间。

• 在协议详情页「培训」标签，可查看所有成员对该协议的培训状态（已完成 / 未培训 / 即将过期 / 已过期）
• 若成员在实验中引用了需要培训但本人尚未完成培训的协议，系统显示橙色提醒（不阻止使用，但记录在审计日志中）
• 培训记录与仪器培训要求联动，仪器操作 SOP 的培训完成情况可作为仪器使用授权的前提条件

1. 在左侧导航点击「模板市场」，或在协议列表页点击「浏览模板」按钮，进入模板市场页面。
2. 使用以下方式筛选和搜索模板：
   • 在搜索框输入关键词（如「Western blot」「细胞培养」）
   • 按「研究领域」筛选：分子生物学 / 细胞生物学 / 蛋白质组学 / 基因组学 / 化学合成 / 其他
   • 按「实验类型」筛选：提取 / 检测 / 分析 / 合成 / 维护 / 其他
   • 按「步骤数量」排序（少→多 或 多→少）
   • 按「使用次数」排序（热门优先）
3. 点击模板卡片，查看模板预览：
   • 模板描述、步骤数量、适用范围
   • 版本号和最近更新时间
   • 被使用次数和评分（社区反馈）
   • 发布团队/用户信息
   • 完整的步骤内容预览（前 5 步）
4. 确认模板适合后，点击「导入到我的团队」，系统在你的团队中创建该模板的完整副本（不影响原始模板）。
5. 导入的协议以「草稿」状态出现在你的协议列表中，可以自由修改内容、补充适合本团队的细节后，走正常的审核发布流程。

1. 在已发布协议的详情页，点击「发布到模板市场」按钮（需要 SUPER_ADMIN 权限或管理员授权）。
2. 填写市场展示信息：
   • 模板简介：面向社区的说明，强调该协议的适用场景和特点
   • 研究领域标签：从预设标签中选择（多选）
   • 适用仪器型号：列出所需仪器的品牌和型号
   • 适用样品类型：人/鼠/细胞系/纯化蛋白等
   • 所需资质：操作该 SOP 需要的培训或经验
3. 选择是否允许其他用户留下评论和评分（建议开启，有助于改进）。
4. 点击「提交审核」，模板进入 PonyLab 平台的内容审核队列（通常 1–2 个工作日）。审核通过后模板公开上架。

1. 在新建协议界面（或协议编辑器），点击「AI 解析」按钮，选择「从文本解析」。
2. 在文本框中粘贴实验方法文本。适合粘贴的来源：
   • 论文的 Methods/Materials and Methods 部分
   • 产品说明书的操作步骤部分
   • 内部 Word 文档中的 SOP 文本
   • 邮件中描述的实验方案
3. 点击「解析」按钮，AI 分析文本并自动识别：
   • 操作步骤（通过数字编号、「首先」「然后」「最后」等连接词识别）
   • 操作参数（温度、时间、转速、浓度等数值）
   • 所需材料（试剂名称、仪器名称）
   • 安全注意事项（含「危险」「注意」「警告」等关键词的句子）
4. AI 解析完成后（通常 3–10 秒），结果显示在右侧预览面板中，以结构化步骤格式呈现。
5. 仔细检查每个解析出的步骤，可直接在预览面板中编辑：
   • 点击步骤文字可直接编辑
   • 拖动步骤可调整顺序
   • 点击「＋」在步骤间插入新步骤
   • 点击「✕」删除不需要的步骤
6. 确认解析结果无误后，点击「导入到协议」，解析出的步骤填入协议编辑器。

1. 点击「AI 解析」→「上传 PDF」，或直接将 PDF 文件拖入上传区域。
2. 系统对 PDF 进行 OCR（光学字符识别）处理，支持：
   • 中文、英文（以及中英混合）文档
   • 扫描版 PDF（通过 OCR 识别图片中的文字）
   • 含表格的 PDF（表格内容会被保留结构）
   • 多页 PDF（单次上传不超过 20 MB，页数不超过 200 页）
3. 上传后，若 PDF 有多个章节，系统会显示章节目录，供你选择要解析哪些章节（例如只解析「操作方法」章节，跳过「背景介绍」）。
4. AI 识别 PDF 中的操作步骤部分并提取为结构化步骤列表，流程与文本解析相同（步骤 4–6）。